MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium phage THSA-485A

Total Repeats: 893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018264	TAA	2	6	100	105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912606
2	NC_018264	TA	3	6	164	169	50 %	50 %	0 %	0 %	397912606
3	NC_018264	T	8	8	181	188	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
4	NC_018264	CGC	2	6	208	213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397912606
5	NC_018264	TTC	2	6	278	283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912606
6	NC_018264	ATT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912606
7	NC_018264	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
8	NC_018264	TTC	3	9	368	376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912606
9	NC_018264	T	6	6	384	389	0 %	100 %	0 %	0 %	397912606
10	NC_018264	TC	3	6	502	507	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
11	NC_018264	CAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912607
12	NC_018264	TA	4	8	631	638	50 %	50 %	0 %	0 %	397912607
13	NC_018264	T	7	7	671	677	0 %	100 %	0 %	0 %	397912607
14	NC_018264	TC	3	6	725	730	0 %	50 %	0 %	50 %	397912607
15	NC_018264	GGAG	2	8	750	757	25 %	0 %	75 %	0 %	397912607
16	NC_018264	TCT	2	6	766	771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912607
17	NC_018264	CTAT	2	8	780	787	25 %	50 %	0 %	25 %	397912607
18	NC_018264	TTA	2	6	992	997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912608
19	NC_018264	AG	3	6	1003	1008	50 %	0 %	50 %	0 %	397912608
20	NC_018264	TAC	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912608
21	NC_018264	GAA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912608
22	NC_018264	CATA	2	8	1131	1138	50 %	25 %	0 %	25 %	397912608
23	NC_018264	GAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912608
24	NC_018264	ATG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912608
25	NC_018264	TCATA	2	10	1214	1223	40 %	40 %	0 %	20 %	397912608
26	NC_018264	AAT	2	6	1410	1415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912609
27	NC_018264	AT	3	6	1465	1470	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
28	NC_018264	TCT	3	9	1517	1525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912609
29	NC_018264	A	7	7	1540	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	397912609
30	NC_018264	TCA	2	6	1547	1552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912609
31	NC_018264	TA	3	6	1592	1597	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
32	NC_018264	TA	3	6	1629	1634	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
33	NC_018264	TGGTT	2	10	1669	1678	0 %	60 %	40 %	0 %	397912609
34	NC_018264	AT	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	397912609
35	NC_018264	TTC	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912609
36	NC_018264	AGA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912609
37	NC_018264	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912609
38	NC_018264	TCTATT	2	12	1799	1810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912609
39	NC_018264	T	6	6	1839	1844	0 %	100 %	0 %	0 %	397912609
40	NC_018264	ATG	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912609
41	NC_018264	CTG	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912610
42	NC_018264	CTTC	2	8	2135	2142	0 %	50 %	0 %	50 %	397912610
43	NC_018264	CGA	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912610
44	NC_018264	GA	3	6	2176	2181	50 %	0 %	50 %	0 %	397912610
45	NC_018264	TAC	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912610
46	NC_018264	CCT	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397912610
47	NC_018264	CTATGT	2	12	2322	2333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	397912610
48	NC_018264	TTTA	2	8	2400	2407	25 %	75 %	0 %	0 %	397912611
49	NC_018264	TA	3	6	2554	2559	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
50	NC_018264	TTG	2	6	2615	2620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912611
51	NC_018264	T	6	6	2667	2672	0 %	100 %	0 %	0 %	397912611
52	NC_018264	CTT	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912611
53	NC_018264	TGT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912611
54	NC_018264	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	397912611
55	NC_018264	CT	3	6	2765	2770	0 %	50 %	0 %	50 %	397912611
56	NC_018264	AAC	3	9	2816	2824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912611
57	NC_018264	TCG	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912611
58	NC_018264	TAAAT	2	10	2834	2843	60 %	40 %	0 %	0 %	397912611
59	NC_018264	CTG	2	6	3172	3177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912612
60	NC_018264	AATCTA	2	12	3195	3206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397912612
61	NC_018264	TCG	2	6	3252	3257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912612
62	NC_018264	GAC	2	6	3349	3354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912612
63	NC_018264	T	7	7	3387	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	397912612
64	NC_018264	TTC	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912612
65	NC_018264	CTA	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912613
66	NC_018264	CTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912613
67	NC_018264	GCA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912613
68	NC_018264	TTC	3	9	3567	3575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
69	NC_018264	CTAA	2	8	3613	3620	50 %	25 %	0 %	25 %	397912613
70	NC_018264	GTA	2	6	3708	3713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912613
71	NC_018264	GTT	2	6	3759	3764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912613
72	NC_018264	TCTT	2	8	3787	3794	0 %	75 %	0 %	25 %	397912613
73	NC_018264	AT	4	8	3805	3812	50 %	50 %	0 %	0 %	397912613
74	NC_018264	GCA	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912613
75	NC_018264	TTC	3	9	3831	3839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
76	NC_018264	AAC	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912613
77	NC_018264	TGAC	2	8	3884	3891	25 %	25 %	25 %	25 %	397912613
78	NC_018264	AAT	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912613
79	NC_018264	TCT	2	6	3925	3930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
80	NC_018264	TCT	2	6	3940	3945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912613
81	NC_018264	GAG	2	6	3962	3967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397912613
82	NC_018264	TTTTCA	2	12	4001	4012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	397912613
83	NC_018264	T	6	6	4013	4018	0 %	100 %	0 %	0 %	397912613
84	NC_018264	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
85	NC_018264	AGTTGC	2	12	4399	4410	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	397912614
86	NC_018264	TTA	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
87	NC_018264	TGT	2	6	4435	4440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912614
88	NC_018264	TAG	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912614
89	NC_018264	GCTG	2	8	4472	4479	0 %	25 %	50 %	25 %	397912614
90	NC_018264	TTA	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912614
91	NC_018264	GAT	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912614
92	NC_018264	CTT	2	6	4518	4523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912614
93	NC_018264	TTC	2	6	4568	4573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912614
94	NC_018264	CAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
95	NC_018264	GCA	2	6	4646	4651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912614
96	NC_018264	TCCT	2	8	4660	4667	0 %	50 %	0 %	50 %	397912614
97	NC_018264	CAA	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
98	NC_018264	CTG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912614
99	NC_018264	TAC	2	6	4705	4710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912614
100	NC_018264	TGT	2	6	4763	4768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912614
101	NC_018264	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912614
102	NC_018264	ATTT	2	8	4915	4922	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
103	NC_018264	T	6	6	4952	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	397912615
104	NC_018264	TTTA	2	8	4960	4967	25 %	75 %	0 %	0 %	397912615
105	NC_018264	ATC	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912615
106	NC_018264	AT	3	6	4978	4983	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
107	NC_018264	TAA	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912615
108	NC_018264	GTT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912615
109	NC_018264	TGA	2	6	5159	5164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912615
110	NC_018264	CAA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912615
111	NC_018264	AAT	2	6	5235	5240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912615
112	NC_018264	TAAG	2	8	5321	5328	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
113	NC_018264	TAAG	2	8	5390	5397	50 %	25 %	25 %	0 %	397912615
114	NC_018264	CTT	2	6	5445	5450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912615
115	NC_018264	TC	3	6	5459	5464	0 %	50 %	0 %	50 %	397912615
116	NC_018264	TA	3	6	5510	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	397912615
117	NC_018264	ACTG	2	8	5595	5602	25 %	25 %	25 %	25 %	397912615
118	NC_018264	AGT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912616
119	NC_018264	CGGTTG	2	12	5851	5862	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	397912616
120	NC_018264	CTA	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
121	NC_018264	ACT	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
122	NC_018264	TTG	2	6	6031	6036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912616
123	NC_018264	CCT	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397912616
124	NC_018264	ATC	2	6	6109	6114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
125	NC_018264	ATG	2	6	6179	6184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912616
126	NC_018264	CGT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912616
127	NC_018264	TAC	2	6	6204	6209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
128	NC_018264	GCT	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397912616
129	NC_018264	GTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912616
130	NC_018264	TTC	2	6	6300	6305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912616
131	NC_018264	TGT	2	6	6356	6361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397912616
132	NC_018264	TGG	2	6	6397	6402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397912616
133	NC_018264	TCA	2	6	6423	6428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
134	NC_018264	CTT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912616
135	NC_018264	TAC	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912616
136	NC_018264	ATA	2	6	6592	6597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912616
137	NC_018264	GT	3	6	6616	6621	0 %	50 %	50 %	0 %	397912616
138	NC_018264	AAT	2	6	6652	6657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397912616
139	NC_018264	TCT	3	9	6794	6802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
140	NC_018264	CTT	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
141	NC_018264	CTGT	2	8	6813	6820	0 %	50 %	25 %	25 %	397912617
142	NC_018264	CTT	2	6	6822	6827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912617
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149	NC_018264	ATG	2	6	7099	7104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397912617
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152	NC_018264	CTTT	2	8	7166	7173	0 %	75 %	0 %	25 %	397912617
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158	NC_018264	TAT	2	6	7335	7340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912618
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162	NC_018264	AT	4	8	7598	7605	50 %	50 %	0 %	0 %	397912619
163	NC_018264	TTCTT	2	10	7708	7717	0 %	80 %	0 %	20 %	397912619
164	NC_018264	ACT	2	6	7736	7741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397912619
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166	NC_018264	TTTC	2	8	7770	7777	0 %	75 %	0 %	25 %	397912619
167	NC_018264	CTTC	2	8	7803	7810	0 %	50 %	0 %	50 %	397912619
168	NC_018264	TTC	2	6	7822	7827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397912619
169	NC_018264	T	6	6	7872	7877	0 %	100 %	0 %	0 %	397912620
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172	NC_018264	ATT	2	6	7989	7994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397912620
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255	NC_018264	CA	3	6	11385	11390	50 %	0 %	0 %	50 %	397912624
256	NC_018264	CAA	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397912624
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261	NC_018264	AGA	2	6	11574	11579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397912625
262	NC_018264	T	6	6	11647	11652	0 %	100 %	0 %	0 %	397912625
263	NC_018264	GAC	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397912625
264	NC_018264	A	6	6	11670	11675	100 %	0 %	0 %	0 %	397912625
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266	NC_018264	TA	3	6	11793	11798	50 %	50 %	0 %	0 %	397912625
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